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血液直接PCR試劑盒Blood Advanced Direct PCR Kit

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詳細介紹

        Blood Advanced Direct PCR Kit是一款可直接對全血樣本進行PCR擴增而無需進行DNA純化或樣本預處理的試劑盒,兼容含EDTA、肝素、檸檬酸鹽等常規抗凝劑的新鮮血液、冷藏(凍)血液及Whatman903®FTA®商用干血漬。試劑盒中含有經過經基因工程改造的DNA Polymerase組合,具有保真性高、對PCR抑制劑耐受性強的特點,2× Hieff® Blood Advanced PCR Buffer中添加強力延伸因子、擴增增強因子以及優化的緩沖體系,能夠在快速延伸條件下高效擴增8 kb的基因組片段,對于2 kb以下的片段,設置3-5 sec/kb延伸時間即可完成擴增,從而大幅縮短血液樣本的鑒定及檢測時間。

       Hieff® Advanced High-Fidelity DNA Polymerase Mix的擴增產物的3’端為平末端,適用于一步法快速克隆及TOPO克隆試劑盒(Yeasen CAT# 10907/10908/10909/10910/10911/10912/10922)。
  試劑盒中提供的引物預混液Positive control primer mix (10 μM each)能夠從哺乳動物和大多數脊椎動物的sox21基因上游保守序列中擴增出長度237 bp的片段,可作為陽性對照使用。

 

產品組分

編號

名稱

10188ES20

10188ES50

10188ES60

10188ES76

10188-A

2× Hieff® Blood Advanced PCR Buffer

500 μL

1.25 mL

2.5 mL

12.5 mL

10188-B

Hieff® Advanced High-Fidelity DNA Polymerase Mix

20 μL

50 μL

100 μL

500 μL

10188-C

Positive control primer mix (10 μM each)

100 μL

100 μL

200 μL

500 μL

10188-D

10× DNA loading buffer

1 mL

1 mL

1 mL

1 mL × 5

 

運輸與保存方式

干冰運輸。-20保存,有效期1年。

 

適用范圍

不同類型的全血樣本直接PCR反應。

 

注意事項

1. 推薦血液模板使用量為反應總體積的10%50 μL反應體系中加入5 μL全血作為模板,注意避免吸取血液凝塊。
2. 延伸時間10 sec/kb可擴增8 kb以下大部分目的片段,3-5 sec/kb即可擴增大部分2 kb以下片段。若擴增效率較低,可適當延長時間至30 sec/kb
3. PCR反應結束后,推薦將反應產物于4000 rpm (1000× g) 離心1-3 min以沉淀血細胞碎片,取上清進行下游分析。
4. 本產品不可直接用于醫療診斷。
5. 為了您的安全和健康,請穿實驗服并佩戴一次性手套操作。

 

PCR反應體系a

組分

體積

ddH2O

to 50 μL

2× Hieff® Blood Advanced PCR Buffer

25 μL

Forward Primer (10 μM) b

2 μL

Reverse Primer (10 μM) b

2 μL

Hieff® Advanced High-Fidelity DNA Polymerase Mix

1 μL

血液樣本c

X

a 使用前請充分混勻各組分。

b 推薦每條引物的使用終濃度為0.4 μM,過高會導致非特異性擴增。

c 最佳全血模板濃度范圍為0.5%-20%,推薦使用量為10%作為初始嘗試條件,即50 μL反應體系中加入5 μL全血作為模板,注意避免吸取血液凝塊。對于貯存在Whatman®濾紙卡上的干血漬,則可取約1 mm2帶血漬的圓紙片,無需進行預處理,直接放入PCR反應液中即可進行擴增。


PCR反應條件

循環步驟

溫度

時間

循環數

預變性

95℃

5 min

1

變性

95℃

15 sec

30-35

退火a

60℃

15 sec

延伸b

72℃

3-10 sec/kb

終延伸

72℃

5 min

1

a 退火溫度為通用Tm值或低于引物Tm1-2℃。如果擴增產物特異性較差,可以建立退火溫度梯度以尋找最佳退火條件。

b 延伸時間10 sec/kb可擴增8 kb以下大部分目的片段,3-5 sec/kb即可擴增大部分2 kb以下片段。若擴增效率較低,可適當延長時間至20-30 sec/kb,不應超過60 sec/kb


PCR產物分析
PCR反應結束后,推薦將反應產物于4000 rpm (1000× g) 離心1-3 min以沉淀血細胞碎片,取上清進行下游分析。該步驟可消除全血中多種殘留成分對電泳檢測的干擾,對使用高濃度血液作為模板的PCR產物尤為必要。通常,5 μL/50 μL (10%)反應產物可取30-35 μL上清,3 μL/50 μL (5%)反應產物可取40-45 μL上清。若需對PCR產物進行其它分析,例如酶切等,應將產物稀釋2-4倍以降低反應中的鹽及其它抑制劑對反應的干擾。


對照反應
試劑盒內提供引物預混液Positive Control Primer Mix (10 μM each) 用于陽性對照反應。可從哺乳動物及其他許多脊椎動物的基因組sox 21基因上游序列中擴增出237 bp的片段,該擴增區是一段高度保守的非編碼區。
Primer F: 5'- AGCCCTTGGGGASTTGAATTGCTG -3'   
Primer R: 5'- GCACTCCAGAGGACAGCRGTGTCAATA -3'

 

常見問題與解決方案

無擴增產物或產量少

產物呈現高分子量彌散條帶

產物呈現低分子量彌散條帶

檢查引物設計,確認引物濃度和純度

提高退火溫度或設置退火梯度

電泳前離心取上清

重復實驗,確認體系、程序無誤

延伸時間不應過長

提高退火溫度或設置退火梯度

增加循環數

嘗試不同的血液用量

嘗試不同的血液用量

優化退火溫度

減少循環數

減少循環數

嘗試不同的血液用量

降低引物濃度

降低引物濃度

重新設計引物

 

重新設計引物

HB220617

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